Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms