Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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