Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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