Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn3Q9CVD2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn3Q9CVD2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms