Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms