Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb9Q9CQJ8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms