Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms