Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncbp2Q9CQ49 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncbp2Q9CQ49 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms