Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NenfQ9CQ45 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NenfQ9CQ45 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms