Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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