Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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