Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf17Q99MV7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf17Q99MV7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rnf17Q99MV7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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