Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms