Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp16Q99LG0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp16Q99LG0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp16Q99LG0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp16Q99LG0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp16Q99LG0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms