Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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