Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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