Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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