Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smc1bQ920F6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms