Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rhbdd2Q8VEK2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms