Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc8Q8VD72 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms