Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd1Q8VCZ8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms