Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rdh10Q8VCH7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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