Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg10Q8R1P4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms