Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r72Q8K3N7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r72Q8K3N7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r72Q8K3N7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r72Q8K3N7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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