Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Lrrtm1Q8K377 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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