Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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