Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms