Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Stam2-201ENSMUST00000102759 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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