Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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