Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc38Q8CDN8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc38Q8CDN8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc38Q8CDN8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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