Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Nhlrc3Q8CCH2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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