Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Fbxo48Q8CAT8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Fbxo48Q8CAT8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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