Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhsl1Q8CAF4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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