Protein–RNA interactions for Protein: Q8C196

Cps1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, mousemouse

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Length 1,500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cps1Q8C196 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cps1Q8C196 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cps1Q8C196 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cps1Q8C196 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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