Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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