Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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