Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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