Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms