Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4dQ8BGV9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4dQ8BGV9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4dQ8BGV9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4dQ8BGV9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4dQ8BGV9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms