Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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