Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms