Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AknaQ80VW7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AknaQ80VW7 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms