Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rpl15-ps4-201ENSMUST00000122372 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnphQ80U23 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms