Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf7ipQ7TT18 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms