Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms