Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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