Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms