Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms