Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms