Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms